| Název stanice | číslo traťového úseku v mapě na těchto stránkách. Pozor - ve starších mapách mohou být čísla jiná. |
| Žabčice | 250 |
| Žabokliky | 160 |
| Žabonosy | 012 |
| Žabovřesky nad Ohří | 095 |
| Žacléř | 043 |
| Žalany | 097 |
| Žalany zastávka | 097 |
| Žalhostice | 087 |
| Žamberk | 021 |
| Žandov | 081 |
| Žatec | 120, 123 |
| Žatec západ | 123, 160 |
| Žďár nad Metují | 026 |
| Žďár nad Orlicí | 020 |
| Žďár nad Sázavou | 250, 251 |
| Žďár u Kamenice nad Lipou | 205 |
| Žďárec u Skutče | 238, 261 |
| Ždírec nad Doubravou | 238 |
| Ždírec u Plzně | 190 |
| Ždov | 165 |
| Želeč | 120 |
| Želechovice nad Dřevnicí | 331 |
| Želechovice nad Dřevnicí - Lípa | 331 |
| Želenice nad Bílinou | 130 |
| Želenice u Slaného | 121 |
| Želénky | 130 |
| Železná Ruda | 183 |
| Železná Ruda město | 183 |
| Železnice | 041 |
| Železný Brod | 030, 036 |
| Želina | 164 |
| Želivec | 235 |
| Želvice | 191 |
| Ženklava | 325 |
| Žihle | 160 |
| Žichlínek | 270 |
| Žichovice | 185 |
| Žim | 097 |
| Žireč | 030 |
| Živonín | 076 |
| Životice | 191 |
| Žiželice | 120 |
| Žlábek | 194 |
| Žlebské Chvalovice | 236 |
| Žleby | 236 |
| Žleby zastávka | 236 |
| Žloukovice | 174 |
| Žlutice | 161 |
| Žulová | 295 |