| Název stanice | číslo traťového úseku |
| Tábor | 201, 202, 220, 224, 226 |
| Tachov | 184 |
| Tachov zastávka | 184 |
| Tachov - Bíletín | 184 |
| Tample | 040 |
| Tanvald | 035, 036 |
| Tanvald zastávka | 036 |
| Tanvaldský Špičák (v provozu od 3.11.2005) | 034 |
| Tatce | 011 |
| Tatenice | 270 |
| Těchonín | 024 |
| Telce | 110 |
| Telč | 203 |
| Telnice | 132 |
| Temelín | 192 |
| Teplá | 149 |
| Teplice lesní brána | 132 |
| Teplice nad Bečvou | 280 |
| Teplice nad Metují | 026, 047 |
| Teplice nad Metují skály | 047 |
| Teplice nad Metují zastávka | 047 |
| Teplice v Čechách | 097, 130 |
| Teplice zámecká zahrada | 097 |
| Teplička u Karlových Varů | 149 |
| Terezín u Čejče | 256 |
| Tešetice | 163 |
| Tešice | 333 |
| Tetčice | 240 |
| Tchořovice | 191 |
| Tisová u Nejdku | 142 |
| Tišice | 070 |
| Tišnov | 250, 251 |
| Tištín | 333 |
| Tlučná | 180 |
| Tlumačov | 330 |
| Tmáň | 096 |
| Točník | 183 |
| Tochovice | 200 |
| Tomice | 220 |
| Tomíkovice | 293 |
| Topol | 015 |
| Toušice | 013 |
| Toužim | 161 |
| Tovačov | 334 |
| Trhanov | 184 |
| Trhový Štěpánov | 223 |
| Trmice | 131 |
| Trnová | 076 |
| Trnovany | 120 |
| Trnovany u Litoměřic | 087 |
| Trocnov | 190 |
| Trocnov zastávka | 190 |
| Trojany | 162 |
| Troubelice | 290 |
| Troubelice zastávka | 290 |
| Troubsko | 240, 244 |
| Trpík | 263 |
| Trpísty | 175 |
| Tršnice | 140, 146, 147 |
| Trutnov hlavní nádraží | 032, 040, 043, 045, 047 |
| Trutnov střed | 032, 043, 047 |
| Trutnov zastávka | 047 |
| Trutnov - Poříčí | 032, 043 |
| Trutnov - Staré Město | 045 |
| Tržek | 016 |
| Třebčice | 191 |
| Třebčín | 275 |
| Třebechovice po Orebem | 020 |
| Třebelice | 224 |
| Třebelovice | 234 |
| Třebeň | 146 |
| Třebenice | 113 |
| Třebenice město | 113 |
| Třebestovice | 060 |
| Třebětice | 300 |
| Třebíč | 240 |
| Třebíč - Borovina | 240 |
| Třebívlice | 113 |
| Třeboň | 226 |
| Třeboň lázně | 226 |
| Třebovětice | 041 |
| Třebovice v Čechách | 263, 270 |
| Třebušice | 130 |
| Třemešná ve Slezsku | 290, 296 |
| Třemešné pod Přimdou | 184 |
| Třemošná u Plzně | 160 |
| Třemošná u Plzně zastávka | 160 |
| Třemošnice | 236 |
| Třešť | 203 |
| Třešť město | 203 |
| Třinec | 320 |
| Třinec - Konská | 320 |
| Třísov | 194 |
| Tuchoměřice | 121 |
| Tuklaty | 011 |
| Tuněchody | 015 |
| Turnov | 030, 041, 070 |
| Turnov město | 041 |
| Tvršice | 123 |
| Týn nad Vltavou | 192 |
| Týnec nad Labem | 010 |
| Týnec nad Sázavou | 210 |
| Týniště nad Orlicí | 020, 026 |