| Název stanice | číslo traťového úseku |
| Pacov | 202 |
| Pačejov | 190 |
| Padařov | 201 |
| Páleček | 110 |
| Panský | 084, 085 |
| Pardubice | 010, 030, 031, 238, 270 |
| Pardubice zastávka | 010 |
| Pardubice závodiště | 238 |
| Paskov | 300 |
| Pastuchovice | 160 |
| Pátek | 114 |
| Pavlov | 120 |
| Pavlovice | 170 |
| Pec pod Sněžkou | 904 |
| Pecerady | 210 |
| Peč | 203 |
| Pěčín | 022 |
| Pečky | 011, 012 |
| Peklo nad Zdobnicí | 022 |
| Pěkná | 194 |
| Pelhřimov | 202 |
| Pernek na Šumavě | 194 |
| Pernink | 142 |
| Pernolec | 184 |
| Perštejn | 140 |
| Pertoltice po Ralskem | 086 |
| Peruc | 110 |
| Pětipsy | 164 |
| Petrkov | 237 |
| Petrohrad | 160 |
| Petrov nad Desnou | 291 |
| Petrov u Prahy | 210 |
| Petrov u Strážnice | 341 |
| Petrov-Chlomek | 210 |
| Petrovice nad Orlicí | 020 |
| Petrovice nad Úhlavou | 183 |
| Petrovice u Karviné | 320, 326 |
| Petříkov | 190 |
| Petříkovice | 047 |
| Pilínkov | 030 |
| Pilníkov | 040 |
| Písečná | 290 |
| Písek | 200, 201 |
| Písek město | 201 |
| Písek zastávka | 200 |
| Pitín | 340 |
| Pitín zastávka | 340 |
| Pivín | 332 |
| Plačkov | 237 |
| Planá nad Lužnicí | 220 |
| Planá u Mariánských Lázní | 170, 184 |
| Plaňany | 012 |
| Plaňany zastávka | 012 |
| Plasy | 160 |
| Platěnice | 015 |
| Plavy | 036 |
| Plesná | 147 |
| Plešnice | 170 |
| Plešovice | 194 |
| Plchůvky | 026 |
| Ploskovice | 087 |
| Plotiště nad Labem | 041 |
| Ploužnice | 064 |
| Plužiny | 222 |
| Plzeň hlavní nádraží | 160, 170, 180, 183, 190 |
| Plzeň Jižní předměstí | 170, 180 |
| Plzeň zastávka | 183 |
| Plzeň-Bílá Hora | 160 |
| Plzeň-Doubravka | 170 |
| Plzeň-Dudlevce | 183 |
| Plzeň-Koterov | 190 |
| Plzeň-Křimice | 170 |
| Plzeň-Skvrňany | 180 |
| Plzeň-Valcha | 183 |
| Pňovany | 170, 175 |
| Pňovany zastávka | 170 |
| Poběžovice | 182, 184 |
| Pocinovice | 185 |
| Počátky - Žirovnice | 204 |
| Počerady | 123 |
| Podbořany | 160 |
| Poděbrady | 020, 231 |
| Podhradí | 148 |
| Podhůří | 044 |
| Podivín | 250 |
| Podlesí | 024 |
| Podlešín | 110, 121 |
| Podsedice | 113 |
| Pohled | 250 |
| Pohledští Dvořáci | 250 |
| Pohořelice | 253 |
| Pohořelice dvůr | 253 |
| Pohoří | 026 |
| Pocheň | 313 |
| Pokřikov | 238 |
| Poláky | 164 |
| Polanka nad Odrou | 270, 321 |
| Polečnice | 194 |
| Polepy | 072 |
| Polerady nad Labem | 074 |
| Police nad Metují | 026 |
| Police u Valašského Meziříčí | 300 |
| Police-Žandov | 082 |
| Poličany | 235 |
| Polička | 261 |
| Polichno | 345 |
| Polná | 242 |
| Polná na Šumavě | 194 |
| Polom | 270 |
| Pomezí | 261 |
| Pomezí zastávka | 261 |
| Ponětovice | 340 |
| Poniklá | 042 |
| Poniklá zastávka | 042 |
| Popelín | 204 |
| Popice | 250 |
| Popov | 340 |
| Popovice u Rajhradu | 250 |
| Popovice u Uherského Hradiště | 340 |
| Poříčany | 011, 060 |
| Poříčí nad Sázavou | 210 |
| Poříčí nad Sázavou-Svárov | 210 |
| Pořín | 202 |
| Poseč | 161 |
| Postoloprty | 123 |
| Postoupky | 300 |
| Postřekov | 184 |
| Postřelmov | 291 |
| Postupice | 223 |
| Poštorná | 247 |
| Poteč | 280 |
| Potěhy | 230 |
| Potštejn | 020 |
| Potůčky | 142 |
| Potůčky zastávka | 142 |
| Potůčník | 290 |
| Potvorov | 160 |
| Poutnov | 149 |
| Pouzdřany | 250 |
| Povrly | 090 |
| Povrly-Roztoky | 090 |
| Pozdatín | 252 |
| Pracejovice | 190 |
| Prackovice nad Labem | 090 |
| Praha hlavní nádraží | 010, 011, 020, 060, 070, 090, 091, 120, 122, 140, 170, 171, 210, 221, 226, 230, 231, 250, 270, |
| Praha Masarykovo nádraží | 010, 020, 060, 070, 090, 091, 120, 140, 230, 231, 250, 270 |
| Praha-Běchovice | 011 |
| Praha-Braník | 210 |
| Praha-Bubeneč | 091 |
| Praha-Bubny | 120, 140 |
| Praha-Cibulka | 122 |
| Praha-Čakovice | 070 |
| Praha-Dejvice | 120 |
| Praha-Dolní Počernice | 011 |
| Praha-Hlubočepy | 167 |
| Praha-Holešovice | 010, 011, 090, 091, 230, 250, 270 |
| Praha-Holešovice zastávka | 091 |
| Praha-Holyně | 167 |
| Praha-Horní Měcholupy | 221 |
| Praha-Horní Počernice | 231 |
| Praha-Hostivař | 221 |
| Praha-Jinonice | 122 |
| Praha-Kbely | 070 |
| Praha-Klánovice | 011 |
| Praha-Kolovraty | 221 |
| Praha-Krč | 210 |
| Praha-Kyje | 011 |
| Praha-Libeň | 010, 011, 060, 070, 230, 231, 250, 270 |
| Praha-Modřany | 210 |
| Praha-Modřany zastávka | 210 |
| Praha-Radotín | 171 |
| Praha-Ruzyně | 120 |
| Praha-Řeporyje | 167 |
| Praha-Satalice | 070 |
| Praha-Sedlec | 091 |
| Praha-Smíchov | 010, 011, 020, 060, 167, 170, 171, 220, 221, 230, 250, 270 |
| Praha-Smíchov severní nástupiště | 122 |
| Praha-Stodůlky | 122 |
| Praha-Strašnice zastávka | 221 |
| Praha-Uhříněves | 121 |
| Praha-Veleslavín | 120 |
| Praha-Velká Chuchle | 171 |
| Praha-Vršovice | 210, 220, 221 |
| Praha-Vysočany | 020, 070, 231 |
| Praha-Zbraslav | 210 |
| Praha-Zličín | 122 |
| Praha-Žvahov | 122 |
| Prachatice | 197 |
| Prachatice lázně | 197 |
| Prachovice | 014 |
| Praskačka | 020 |
| Prasklice | 333 |
| Praskolesy | 170 |
| Pravice | 244 |
| Pražák | 197 |
| Proboštov | 130 |
| Proseč nad Nisou | 036 |
| Prosečné | 040 |
| Prosečnice | 210 |
| Prosenice | 270 |
| Prosetice | 097 |
| Prosetín | 238 |
| Prostějov hlavní nádraží | 271, 275, 332 |
| Prostějov místní nádraží | 271, 275 |
| Prostřední Lipka | 024 |
| Protivec | 161, 163 |
| Protivín | 190, 200 |
| Protivín zastávka | 190 |
| Prudká zastávka | 251 |
| Pržno | 300 |
| Předbořice | 235 |
| Předhradí | 261 |
| Předměřice nad Labem | 030 |
| Přední Zborovice | 208 |
| Přehýšov | 181 |
| Přelouč | 010, 014 |
| Přerov | 270, 330, 331 |
| Přeštice | 183 |
| Přeštice-zastávka | 183 |
| Převýšov | 020 |
| Přibice | 253 |
| Příbor | 304 |
| Příbram | 200 |
| Přibyslav | 250 |
| Přibyslav zastávka | 250 |
| Příčina | 162 |
| Příkazy | 275 |
| Příkosice | 173 |
| Příkosice zastávka | 173 |
| Přílepy | 125 |
| Přímělkov | 240 |
| Příšovice | 070 |
| Pšenice | 196 |
| Pševes | 061 |
| Pšovlky | 161 |
| Ptení | 271 |
| Pučery | 234 |
| Pustá Kamenice | 261 |
| Pustá Kamenice zastávka | 261 |
| Pustověty | 166 |
| Putim | 200, 201 |
| Pyšely | 221 |