| Název stanice | číslo traťového úseku |
| Obora u Kaznějova | 160 |
| Obrataň | 202, 205 |
| Obrnice | 110, 113, 123, 131 |
| Obrubce | 063 |
| Očelice | 026 |
| Odrlice | 273 |
| Odry | 276 |
| Ohníč | 131 |
| Ohnišťany | 040 |
| Ohnišťovice | 182 |
| Okna | 080 |
| Okrouhlice | 230 |
| Okříšky | 240, 241 |
| Olbramkostel | 241 |
| Olbramovice | 220, 225 |
| Oldřichov u Duchcova | 130, 132, 134 |
| Oldřichov u Nejdku | 142 |
| Oldřichov v Hájích | 037 |
| Oldřichovice | 905 |
| Oldřiš | 261 |
| Oleško | 090 |
| Olešná na Moravě | 251 |
| Olešná u Rakovníka | 125 |
| Olešnice | 032 |
| Olomouc hlavní nádraží | 270, 275, 290, 310, 332 |
| Olomouc město | 275 |
| Olomouc-Hejčín | 275 |
| Olomouc-Nová Ulice | 275 |
| Olomouc-Nové Sady | 332 |
| Olomouc-Řepčín | 275 |
| Olomouc-Smetanovy sady | 275 |
| Oloví | 145 |
| Olovnice | 110 |
| Olovnice zastávka | 111 |
| Omice | 240 |
| Omlenice | 196 |
| Ondřejovice | 295 |
| Ondřejovice zastávka | 295 |
| Oparno | 097 |
| Opatov | 260 |
| Opatovice nad Labem | 031 |
| Opava-Komárov | 316 |
| Opava východ | 314, 315, 316, 317 |
| Opava západ | 316 |
| Opava zastávka | 317 |
| Oplocany | 334 |
| Opočínek | 010 |
| Opočno pod Orlickými horami | 023, 026 |
| Opočno u Loun | 126 |
| Oráčov | 161 |
| Ořechov | 250 |
| Osek | 134 |
| Osek město | 135 |
| Osenice | 063 |
| Osíčko | 300 |
| Oskořínek | 061 |
| Oslavany | 244 |
| Oslavice | 252 |
| Oslavička | 252 |
| Oslí | 207 |
| Osoblaha | 296 |
| Osov | 207 |
| Osová Bitýška | 250 |
| Ostašov | 086 |
| Ostrava hlavní nádraží | 270, 300, 331 |
| Ostrava střed | 300 |
| Ostrava-Bartovice | 321 |
| Ostrava-Kunčice | 300, 321 |
| Ostrava-Kunčičky | 300 |
| Ostrava-Mariánské Hory | 270 |
| Ostrava-Svinov | 270, 316, 321, 331 |
| Ostrava-Třebovice | 316 |
| Ostrava-Vítkovice | 270, 321 |
| Ostravice | 303 |
| Ostravice zastávka | 303 |
| Ostroměř | 040, 041 |
| Ostrov nad Ohří | 140 |
| Ostrov nad Oslavou | 250 |
| Ostrožská Nová Ves | 340 |
| Ostrožská Nová Ves lázně | 340 |
| Ostružná | 290 |
| Osvračín | 180 |
| Ošelín | 170 |
| Otice | 314 |
| Otovice | 027 |
| Otovice zastávka | 027 |
| Otradovice | 072 |
| Otročín | 161 |
| Otrokovice | 330, 335 |
| Otrokovice zastávka | 330 |
| Otrokovice-Trávníky | 335 |
| Otvovice | 093 |
| Ovčáry | 072 |
| Ovesná | 194 |
| Ovesné Kladruby | 149 |
| Ovesné u Prachatic | 197 |